Vedenie Žilinskej univerzity v Žiline tvorí rektor, prorektori a kvestorka.
Kolégium rektora je poradný orgán rektora. Tvoria ho vedenie univerzity, dekani jednotlivých fakúlt a predseda akademického senátu UNIZA.
Akademický senát Žilinskej univerzity v Žiline je najvyšší samosprávny orgán UNIZA. Skladá sa z volených zástupcov akademickej obce UNIZA.
Vedecká rada Žilinskej univerzity v Žiline je orgán akademickej samosprávy. Členmi vedeckej rady sú významní odborníci z oblastí, v ktorých UNIZA uskutočňuje vzdelávaciu, výskumnú, vývojovú, umeleckú alebo ďalšiu tvorivú činnosť.
Správna rada Žilinskej univerzity v Žiline je orgán ustanovený podľa § 40, 41 zákona NR SR č 131/2002 Z. z. o vysokých školách a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov.
Žilinská univerzita v Žiline realizuje vlastnú edičnú činnosť. Redakčná rada zodpovedá za odbornú kvalitu vydávaných knižných publikácií, schvaľuje recenzentov a určuje vedeckých redaktorov pre publikácie.
